Nebyly provedené studie na těhotných ženách, které by odvrátily, nebo potvrdily negativní účinky clenbuterolu na plod, proto se (dle obecných pravidel) jeho podávání obzvlášť v 1. a ve 3. trimestru nedoporučuje (případně pouze v naléhavých případech a indikacích ho lékař může předepsat). Je ale prokázané, že je clenbuterol vylučován do mateřského mléka, proto se nesmí podávat kojícím ženám, nebo žena v případě nutnosti jeho užívání musí kojení ukončit.